Informoval o tom server iRozhlas.cz s tím, že fond vedl s firmami soudní spory. Ve všech případech byl úspěšný, dceřiné společnosti holdingu Agrofert již vrátily všechny získané prostředky. Konkrétně šlo o firmy Agro Plchov, SPV Pelhřimov, ZS Vilémov, Zeos Brnířov a Oseva Agri Chrudim.
Podniky z holdingu čerpaly podporu na pojištění hospodářských plodin a zvířat. Předloni proběhla prověrka, díky níž vedení PGRLF zjistilo, že některé dotace byly poskytnuty neoprávněně. Firmy totiž nesplňovaly podmínku, že jde o malé a střední podniky.
Fond proto začal poskytnuté prostředky vymáhat zpět. Vedení holdingu Agrofert nejprve odmítlo pochybení, takže kauzy skončily před soudem. Jeho finální rozhodnutí nechtěli zástupci holdingu komentovat.
Spory s fondem měly pro Agrofert důsledky. Neochota vrátit dotace znamenala odstřižení od čerpání těch současných. Fond totiž stanovil podmínky tak, že žadatel o státní podporu nesmí mít nedoplatky vůči státu či další konkrétně jmenovaným institucím.